Protein–RNA interactions for Protein: P61079

Ube2d3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d3P61079 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2d3P61079 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2d3P61079 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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