Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp25P57080 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp25P57080 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp25P57080 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp25P57080 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp25P57080 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Usp25P57080 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp25P57080 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Usp25P57080 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Usp25P57080 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp25P57080 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp25P57080 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp25P57080 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp25P57080 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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