Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Cldn18P56857 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn18P56857 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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