Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmoP56726 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmoP56726 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmoP56726 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmoP56726 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmoP56726 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SmoP56726 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmoP56726 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmoP56726 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SmoP56726 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmoP56726 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmoP56726 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SmoP56726 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmoP56726 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmoP56726 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmoP56726 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmoP56726 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmoP56726 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmoP56726 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmoP56726 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmoP56726 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmoP56726 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmoP56726 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmoP56726 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmoP56726 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmoP56726 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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