Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lim2P56563 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lim2P56563 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lim2P56563 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lim2P56563 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lim2P56563 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lim2P56563 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lim2P56563 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lim2P56563 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lim2P56563 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lim2P56563 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lim2P56563 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms