Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CckbrP56481 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CckbrP56481 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CckbrP56481 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CckbrP56481 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CckbrP56481 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CckbrP56481 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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