Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms