Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp5P56399 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp5P56399 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp5P56399 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp5P56399 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp5P56399 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp5P56399 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms