Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms