Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcanP55066 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcanP55066 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcanP55066 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NcanP55066 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NcanP55066 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NcanP55066 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NcanP55066 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NcanP55066 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NcanP55066 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NcanP55066 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NcanP55066 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NcanP55066 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NcanP55066 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NcanP55066 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NcanP55066 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NcanP55066 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NcanP55066 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NcanP55066 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NcanP55066 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NcanP55066 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcanP55066 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcanP55066 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcanP55066 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcanP55066 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcanP55066 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcanP55066 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcanP55066 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NcanP55066 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcanP55066 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NcanP55066 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NcanP55066 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NcanP55066 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NcanP55066 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcanP55066 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcanP55066 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcanP55066 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcanP55066 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcanP55066 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcanP55066 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcanP55066 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcanP55066 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcanP55066 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcanP55066 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcanP55066 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcanP55066 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcanP55066 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcanP55066 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcanP55066 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NcanP55066 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NcanP55066 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcanP55066 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcanP55066 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcanP55066 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcanP55066 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcanP55066 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcanP55066 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcanP55066 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcanP55066 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcanP55066 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcanP55066 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NcanP55066 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NcanP55066 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcanP55066 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcanP55066 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcanP55066 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NcanP55066 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcanP55066 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcanP55066 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcanP55066 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcanP55066 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcanP55066 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcanP55066 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcanP55066 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcanP55066 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcanP55066 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NcanP55066 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcanP55066 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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