Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc12a1P55014 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc12a1P55014 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc12a1P55014 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc12a1P55014 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc12a1P55014 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc12a1P55014 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc12a1P55014 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc12a1P55014 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc12a1P55014 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc12a1P55014 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc12a1P55014 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc12a1P55014 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a1P55014 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a1P55014 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a1P55014 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a1P55014 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a1P55014 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc12a1P55014 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms