Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms