Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp1P52624 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp1P52624 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms