Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa6P50704 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa6P50704 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa6P50704 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa6P50704 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Defa6P50704 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms