Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
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Tmod1P49813 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Tmod1P49813 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
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Tmod1P49813 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms