Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psen1P49769 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psen1P49769 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psen1P49769 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psen1P49769 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psen1P49769 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psen1P49769 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psen1P49769 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psen1P49769 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms