Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CitP49025 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CitP49025 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CitP49025 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CitP49025 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CitP49025 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CitP49025 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CitP49025 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CitP49025 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CitP49025 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CitP49025 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CitP49025 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CitP49025 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CitP49025 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CitP49025 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CitP49025 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CitP49025 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CitP49025 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CitP49025 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CitP49025 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CitP49025 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CitP49025 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CitP49025 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CitP49025 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CitP49025 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CitP49025 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CitP49025 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CitP49025 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CitP49025 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CitP49025 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CitP49025 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CitP49025 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CitP49025 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CitP49025 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CitP49025 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CitP49025 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CitP49025 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CitP49025 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CitP49025 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CitP49025 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CitP49025 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CitP49025 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CitP49025 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CitP49025 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CitP49025 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CitP49025 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CitP49025 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CitP49025 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms