Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms