Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcntP48725 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcntP48725 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcntP48725 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcntP48725 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcntP48725 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcntP48725 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcntP48725 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcntP48725 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcntP48725 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcntP48725 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcntP48725 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcntP48725 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcntP48725 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcntP48725 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcntP48725 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcntP48725 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcntP48725 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcntP48725 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcntP48725 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcntP48725 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcntP48725 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcntP48725 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcntP48725 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcntP48725 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcntP48725 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcntP48725 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcntP48725 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcntP48725 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcntP48725 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcntP48725 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcntP48725 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcntP48725 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcntP48725 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcntP48725 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcntP48725 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcntP48725 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcntP48725 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcntP48725 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcntP48725 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcntP48725 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcntP48725 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcntP48725 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcntP48725 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcntP48725 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcntP48725 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcntP48725 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcntP48725 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcntP48725 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PcntP48725 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcntP48725 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PcntP48725 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PcntP48725 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcntP48725 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcntP48725 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcntP48725 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcntP48725 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcntP48725 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcntP48725 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcntP48725 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcntP48725 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcntP48725 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcntP48725 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcntP48725 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcntP48725 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcntP48725 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcntP48725 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcntP48725 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcntP48725 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcntP48725 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcntP48725 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcntP48725 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcntP48725 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcntP48725 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcntP48725 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcntP48725 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcntP48725 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PcntP48725 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcntP48725 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcntP48725 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcntP48725 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcntP48725 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcntP48725 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcntP48725 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcntP48725 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcntP48725 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PcntP48725 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PcntP48725 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PcntP48725 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcntP48725 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PcntP48725 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcntP48725 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcntP48725 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcntP48725 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcntP48725 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcntP48725 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcntP48725 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcntP48725 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcntP48725 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcntP48725 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms