Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl13P47963 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms