Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gli1P47806 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gli1P47806 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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