Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx1-2P42580 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms