Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pik3caP42337 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms