Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpl28P41105 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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