Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TfamP40630 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TfamP40630 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TfamP40630 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TfamP40630 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TfamP40630 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TfamP40630 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TfamP40630 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TfamP40630 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TfamP40630 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TfamP40630 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
TfamP40630 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TfamP40630 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TfamP40630 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TfamP40630 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TfamP40630 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TfamP40630 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TfamP40630 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TfamP40630 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TfamP40630 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TfamP40630 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TfamP40630 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TfamP40630 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TfamP40630 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TfamP40630 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TfamP40630 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TfamP40630 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TfamP40630 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TfamP40630 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TfamP40630 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms