Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VhlP40338 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
VhlP40338 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VhlP40338 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
VhlP40338 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VhlP40338 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
VhlP40338 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VhlP40338 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VhlP40338 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VhlP40338 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VhlP40338 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VhlP40338 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VhlP40338 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VhlP40338 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VhlP40338 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VhlP40338 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VhlP40338 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VhlP40338 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VhlP40338 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VhlP40338 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VhlP40338 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VhlP40338 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VhlP40338 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VhlP40338 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms