Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Chd1P40201 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chd1P40201 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd1P40201 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd1P40201 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd1P40201 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd1P40201 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms