Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf1P39428 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf1P39428 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf1P39428 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf1P39428 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf1P39428 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf1P39428 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf1P39428 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf1P39428 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Traf1P39428 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf1P39428 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms