Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lig1P37913 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig1P37913 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig1P37913 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig1P37913 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig1P37913 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lig1P37913 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig1P37913 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig1P37913 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lig1P37913 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms