Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PpargP37238 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PpargP37238 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PpargP37238 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpargP37238 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PpargP37238 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpargP37238 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpargP37238 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpargP37238 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpargP37238 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PpargP37238 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpargP37238 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpargP37238 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpargP37238 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpargP37238 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PpargP37238 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PpargP37238 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PpargP37238 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PpargP37238 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PpargP37238 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PpargP37238 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PpargP37238 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PpargP37238 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PpargP37238 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PpargP37238 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PpargP37238 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PpargP37238 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PpargP37238 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PpargP37238 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PpargP37238 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PpargP37238 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PpargP37238 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PpargP37238 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PpargP37238 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PpargP37238 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PpargP37238 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PpargP37238 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PpargP37238 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PpargP37238 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PpargP37238 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PpargP37238 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PpargP37238 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PpargP37238 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PpargP37238 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PpargP37238 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PpargP37238 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PpargP37238 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PpargP37238 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PpargP37238 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PpargP37238 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PpargP37238 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PpargP37238 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PpargP37238 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PpargP37238 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PpargP37238 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PpargP37238 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PpargP37238 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PpargP37238 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PpargP37238 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PpargP37238 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PpargP37238 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PpargP37238 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PpargP37238 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PpargP37238 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PpargP37238 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms