Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms