Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin1P35438 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin1P35438 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin1P35438 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin1P35438 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin1P35438 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms