Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn11P35235 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms