Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp4P35123 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp4P35123 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp4P35123 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp4P35123 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp4P35123 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms