Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nedd1P33215 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd1P33215 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms