Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Saa4P31532 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Saa4P31532 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Saa4P31532 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms