Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxa2P31245 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms