Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk4P30285 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk4P30285 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms