Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VtnP29788 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VtnP29788 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VtnP29788 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VtnP29788 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VtnP29788 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VtnP29788 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VtnP29788 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VtnP29788 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VtnP29788 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VtnP29788 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VtnP29788 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VtnP29788 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VtnP29788 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VtnP29788 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VtnP29788 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VtnP29788 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VtnP29788 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VtnP29788 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VtnP29788 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VtnP29788 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VtnP29788 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VtnP29788 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
VtnP29788 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VtnP29788 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VtnP29788 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VtnP29788 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VtnP29788 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VtnP29788 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VtnP29788 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VtnP29788 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VtnP29788 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VtnP29788 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VtnP29788 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VtnP29788 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VtnP29788 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VtnP29788 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VtnP29788 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VtnP29788 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VtnP29788 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VtnP29788 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VtnP29788 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VtnP29788 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VtnP29788 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VtnP29788 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VtnP29788 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VtnP29788 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VtnP29788 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VtnP29788 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VtnP29788 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VtnP29788 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VtnP29788 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VtnP29788 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VtnP29788 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VtnP29788 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VtnP29788 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VtnP29788 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VtnP29788 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VtnP29788 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VtnP29788 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VtnP29788 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VtnP29788 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VtnP29788 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VtnP29788 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VtnP29788 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms