Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc1P29341 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms