Protein–RNA interactions for Protein: P28660

Nckap1, Nck-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap1P28660 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nckap1P28660 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nckap1P28660 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nckap1P28660 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nckap1P28660 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nckap1P28660 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nckap1P28660 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nckap1P28660 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nckap1P28660 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nckap1P28660 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nckap1P28660 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nckap1P28660 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Nckap1P28660 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nckap1P28660 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nckap1P28660 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nckap1P28660 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nckap1P28660 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nckap1P28660 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Nckap1P28660 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nckap1P28660 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nckap1P28660 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nckap1P28660 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nckap1P28660 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nckap1P28660 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms