Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa5P28312 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa5P28312 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa5P28312 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms