Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms