Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U2af2P26369 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U2af2P26369 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U2af2P26369 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U2af2P26369 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
U2af2P26369 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U2af2P26369 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
U2af2P26369 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
U2af2P26369 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
U2af2P26369 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
U2af2P26369 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
U2af2P26369 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
U2af2P26369 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
U2af2P26369 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
U2af2P26369 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
U2af2P26369 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
U2af2P26369 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
U2af2P26369 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms