Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nfkb1P25799 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms