Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd247P24161 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd247P24161 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd247P24161 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd247P24161 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd247P24161 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd247P24161 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms