Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZfaP23607 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZfaP23607 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZfaP23607 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZfaP23607 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZfaP23607 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms