Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif3aP23116 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms