Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TP20293 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TP20293 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
TP20293 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TP20293 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TP20293 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TP20293 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TP20293 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14□□□□□ -0.17
TP20293 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TP20293 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TP20293 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TP20293 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TP20293 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TP20293 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TP20293 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TP20293 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TP20293 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TP20293 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TP20293 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TP20293 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TP20293 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TP20293 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TP20293 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TP20293 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TP20293 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TP20293 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TP20293 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TP20293 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TP20293 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TP20293 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TP20293 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TP20293 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TP20293 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TP20293 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TP20293 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TP20293 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TP20293 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TP20293 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TP20293 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TP20293 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TP20293 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TP20293 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TP20293 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TP20293 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TP20293 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TP20293 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TP20293 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TP20293 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TP20293 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TP20293 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TP20293 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TP20293 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TP20293 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TP20293 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TP20293 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TP20293 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TP20293 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TP20293 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TP20293 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TP20293 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TP20293 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TP20293 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TP20293 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TP20293 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TP20293 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TP20293 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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