Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pou5f1P20263 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms